Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK8P49336 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK8P49336 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK8P49336 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK8P49336 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK8P49336 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK8P49336 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK8P49336 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK8P49336 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK8P49336 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK8P49336 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK8P49336 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK8P49336 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK8P49336 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK8P49336 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK8P49336 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK8P49336 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK8P49336 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK8P49336 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK8P49336 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK8P49336 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK8P49336 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK8P49336 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK8P49336 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK8P49336 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK8P49336 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK8P49336 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK8P49336 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK8P49336 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK8P49336 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK8P49336 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK8P49336 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK8P49336 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK8P49336 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK8P49336 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK8P49336 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK8P49336 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK8P49336 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK8P49336 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK8P49336 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK8P49336 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK8P49336 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK8P49336 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK8P49336 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK8P49336 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK8P49336 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK8P49336 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK8P49336 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK8P49336 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK8P49336 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK8P49336 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK8P49336 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK8P49336 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK8P49336 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK8P49336 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK8P49336 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK8P49336 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK8P49336 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK8P49336 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK8P49336 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK8P49336 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK8P49336 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK8P49336 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK8P49336 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK8P49336 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK8P49336 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK8P49336 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK8P49336 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK8P49336 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK8P49336 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK8P49336 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK8P49336 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK8P49336 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms