Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms