Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP8P40818 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP8P40818 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP8P40818 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP8P40818 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP8P40818 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP8P40818 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP8P40818 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP8P40818 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP8P40818 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP8P40818 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP8P40818 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP8P40818 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP8P40818 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP8P40818 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP8P40818 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP8P40818 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP8P40818 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP8P40818 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP8P40818 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP8P40818 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP8P40818 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP8P40818 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP8P40818 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP8P40818 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP8P40818 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP8P40818 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP8P40818 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP8P40818 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP8P40818 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP8P40818 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP8P40818 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP8P40818 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP8P40818 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP8P40818 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP8P40818 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP8P40818 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP8P40818 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP8P40818 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP8P40818 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP8P40818 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP8P40818 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP8P40818 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP8P40818 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP8P40818 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms