Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT2P35908 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT2P35908 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT2P35908 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT2P35908 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT2P35908 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT2P35908 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT2P35908 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT2P35908 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT2P35908 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT2P35908 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT2P35908 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT2P35908 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT2P35908 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT2P35908 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT2P35908 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT2P35908 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT2P35908 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT2P35908 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT2P35908 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT2P35908 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT2P35908 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT2P35908 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT2P35908 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT2P35908 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT2P35908 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT2P35908 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT2P35908 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT2P35908 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms