Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCD1P33897 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms