Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP2P32456 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP2P32456 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP2P32456 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP2P32456 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP2P32456 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP2P32456 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP2P32456 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP2P32456 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP2P32456 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP2P32456 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP2P32456 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP2P32456 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP2P32456 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP2P32456 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms