Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CLIP1P30622 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP1P30622 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms