Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCKSP29966 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms