Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms