Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB2P29033 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB2P29033 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB2P29033 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB2P29033 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB2P29033 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB2P29033 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB2P29033 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB2P29033 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB2P29033 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB2P29033 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB2P29033 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB2P29033 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB2P29033 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB2P29033 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB2P29033 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB2P29033 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB2P29033 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB2P29033 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB2P29033 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB2P29033 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB2P29033 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB2P29033 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB2P29033 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB2P29033 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB2P29033 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB2P29033 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB2P29033 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB2P29033 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB2P29033 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB2P29033 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB2P29033 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB2P29033 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB2P29033 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB2P29033 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB2P29033 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB2P29033 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms