Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YY1P25490 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
YY1P25490 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YY1P25490 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YY1P25490 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
YY1P25490 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YY1P25490 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YY1P25490 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YY1P25490 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YY1P25490 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YY1P25490 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YY1P25490 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YY1P25490 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YY1P25490 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YY1P25490 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YY1P25490 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
YY1P25490 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YY1P25490 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YY1P25490 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YY1P25490 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YY1P25490 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YY1P25490 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YY1P25490 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YY1P25490 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YY1P25490 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YY1P25490 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
YY1P25490 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YY1P25490 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
YY1P25490 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YY1P25490 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YY1P25490 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YY1P25490 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YY1P25490 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YY1P25490 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YY1P25490 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YY1P25490 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YY1P25490 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YY1P25490 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YY1P25490 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YY1P25490 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YY1P25490 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YY1P25490 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YY1P25490 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YY1P25490 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YY1P25490 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YY1P25490 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YY1P25490 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YY1P25490 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
YY1P25490 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YY1P25490 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YY1P25490 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YY1P25490 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YY1P25490 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YY1P25490 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YY1P25490 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YY1P25490 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YY1P25490 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
YY1P25490 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YY1P25490 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YY1P25490 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YY1P25490 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
YY1P25490 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms