Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2AP24928 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms