Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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