Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB1P23443 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms