Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGFR4P22455 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms