Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA5P20719 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms