Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AMY2BP19961 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms