Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DESP17661 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DESP17661 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DESP17661 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DESP17661 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DESP17661 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DESP17661 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DESP17661 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DESP17661 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DESP17661 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DESP17661 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DESP17661 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DESP17661 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DESP17661 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms