Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTLA4P16410 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms