Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD44P16070 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CD44P16070 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD44P16070 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD44P16070 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD44P16070 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD44P16070 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms