Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC5A1P13866 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms