Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNT1P13805 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms