Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD8P13378 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms