Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA4P12838 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA4P12838 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms