Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms