Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1P11387 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1P11387 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1P11387 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1P11387 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOP1P11387 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1P11387 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1P11387 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1P11387 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1P11387 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1P11387 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1P11387 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1P11387 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1P11387 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1P11387 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1P11387 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOP1P11387 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms