Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
LAMC1P11047 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMC1P11047 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
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