Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RARBP10826 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RARBP10826 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARBP10826 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARBP10826 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARBP10826 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARBP10826 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARBP10826 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARBP10826 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RARBP10826 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RARBP10826 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RARBP10826 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RARBP10826 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RARBP10826 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RARBP10826 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RARBP10826 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARBP10826 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARBP10826 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARBP10826 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARBP10826 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARBP10826 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARBP10826 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARBP10826 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RARBP10826 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARBP10826 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARBP10826 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARBP10826 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RARBP10826 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RARBP10826 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARBP10826 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARBP10826 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARBP10826 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARBP10826 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARBP10826 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARBP10826 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RARBP10826 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RARBP10826 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARBP10826 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARBP10826 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARBP10826 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARBP10826 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARBP10826 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARBP10826 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARBP10826 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARBP10826 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RARBP10826 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARBP10826 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARBP10826 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARBP10826 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARBP10826 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARBP10826 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RARBP10826 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARBP10826 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARBP10826 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RARBP10826 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARBP10826 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RARBP10826 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms