Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD28P10747 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD28P10747 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD28P10747 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD28P10747 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD28P10747 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD28P10747 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD28P10747 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD28P10747 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms