Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CHGAP10645 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHGAP10645 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHGAP10645 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHGAP10645 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHGAP10645 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHGAP10645 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHGAP10645 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHGAP10645 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHGAP10645 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHGAP10645 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHGAP10645 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHGAP10645 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHGAP10645 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CHGAP10645 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHGAP10645 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHGAP10645 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHGAP10645 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHGAP10645 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHGAP10645 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHGAP10645 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHGAP10645 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHGAP10645 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHGAP10645 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHGAP10645 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHGAP10645 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CHGAP10645 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHGAP10645 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHGAP10645 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHGAP10645 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHGAP10645 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHGAP10645 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHGAP10645 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHGAP10645 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHGAP10645 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHGAP10645 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHGAP10645 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHGAP10645 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHGAP10645 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHGAP10645 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHGAP10645 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHGAP10645 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CHGAP10645 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHGAP10645 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHGAP10645 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHGAP10645 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHGAP10645 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHGAP10645 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHGAP10645 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHGAP10645 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHGAP10645 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHGAP10645 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHGAP10645 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHGAP10645 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHGAP10645 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHGAP10645 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHGAP10645 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHGAP10645 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGAP10645 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGAP10645 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGAP10645 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGAP10645 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGAP10645 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGAP10645 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGAP10645 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGAP10645 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGAP10645 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGAP10645 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGAP10645 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGAP10645 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGAP10645 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CHGAP10645 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CHGAP10645 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHGAP10645 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms