Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms