Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms