Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA5P08648 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms