Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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