Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCCAP05165 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCCAP05165 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCCAP05165 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCCAP05165 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCCAP05165 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCCAP05165 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCCAP05165 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCCAP05165 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCCAP05165 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCCAP05165 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCCAP05165 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCCAP05165 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCAP05165 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCAP05165 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCAP05165 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCAP05165 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCAP05165 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCAP05165 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCAP05165 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCAP05165 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCAP05165 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCAP05165 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCAP05165 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCAP05165 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCAP05165 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCAP05165 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCCAP05165 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCCAP05165 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCCAP05165 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCCAP05165 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCCAP05165 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCCAP05165 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCCAP05165 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCCAP05165 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCCAP05165 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCCAP05165 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCCAP05165 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCCAP05165 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCCAP05165 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCCAP05165 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCCAP05165 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCCAP05165 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PCCAP05165 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCCAP05165 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCCAP05165 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCCAP05165 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCCAP05165 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCCAP05165 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCCAP05165 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCCAP05165 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCCAP05165 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCCAP05165 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCCAP05165 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCCAP05165 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCCAP05165 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCCAP05165 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCCAP05165 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCAP05165 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCAP05165 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCAP05165 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCAP05165 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCAP05165 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCAP05165 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCAP05165 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCAP05165 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCAP05165 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCAP05165 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCAP05165 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCAP05165 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCAP05165 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCAP05165 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCAP05165 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCAP05165 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCCAP05165 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCCAP05165 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCCAP05165 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCCAP05165 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCCAP05165 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCCAP05165 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCCAP05165 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCCAP05165 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCCAP05165 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCCAP05165 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCCAP05165 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCCAP05165 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCCAP05165 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCCAP05165 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCCAP05165 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCCAP05165 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCCAP05165 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCCAP05165 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCCAP05165 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCCAP05165 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCCAP05165 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCCAP05165 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCCAP05165 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCCAP05165 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCCAP05165 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCCAP05165 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms