Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC4A1P02730 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC4A1P02730 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms