Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGAP02671 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGAP02671 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGAP02671 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGAP02671 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGAP02671 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGAP02671 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FGAP02671 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FGAP02671 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGAP02671 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGAP02671 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGAP02671 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGAP02671 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FGAP02671 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGAP02671 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGAP02671 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGAP02671 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGAP02671 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGAP02671 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGAP02671 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGAP02671 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGAP02671 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGAP02671 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGAP02671 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGAP02671 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGAP02671 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGAP02671 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGAP02671 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGAP02671 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGAP02671 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
FGAP02671 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGAP02671 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGAP02671 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGAP02671 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGAP02671 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGAP02671 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGAP02671 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGAP02671 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGAP02671 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGAP02671 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGAP02671 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms