Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTAP01040 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTAP01040 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTAP01040 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTAP01040 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTAP01040 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTAP01040 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTAP01040 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTAP01040 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTAP01040 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTAP01040 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTAP01040 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTAP01040 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTAP01040 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTAP01040 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSTAP01040 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSTAP01040 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSTAP01040 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSTAP01040 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms