Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms