Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN5O75503 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN5O75503 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN5O75503 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN5O75503 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN5O75503 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN5O75503 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN5O75503 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN5O75503 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN5O75503 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLN5O75503 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLN5O75503 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLN5O75503 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLN5O75503 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN5O75503 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN5O75503 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN5O75503 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN5O75503 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN5O75503 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN5O75503 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN5O75503 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN5O75503 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN5O75503 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN5O75503 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN5O75503 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN5O75503 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN5O75503 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLN5O75503 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms