Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIPSNAP2O75323 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms