Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BRD4O60885 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BRD4O60885 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
BRD4O60885 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BRD4O60885 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRD4O60885 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BRD4O60885 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRD4O60885 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRD4O60885 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BRD4O60885 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRD4O60885 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRD4O60885 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRD4O60885 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BRD4O60885 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRD4O60885 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRD4O60885 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BRD4O60885 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRD4O60885 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRD4O60885 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRD4O60885 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BRD4O60885 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRD4O60885 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BRD4O60885 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRD4O60885 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRD4O60885 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BRD4O60885 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRD4O60885 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRD4O60885 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRD4O60885 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BRD4O60885 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BRD4O60885 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BRD4O60885 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BRD4O60885 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRD4O60885 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BRD4O60885 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRD4O60885 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRD4O60885 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BRD4O60885 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD4O60885 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BRD4O60885 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BRD4O60885 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BRD4O60885 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BRD4O60885 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BRD4O60885 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD4O60885 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BRD4O60885 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD4O60885 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BRD4O60885 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BRD4O60885 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD4O60885 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD4O60885 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BRD4O60885 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD4O60885 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BRD4O60885 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD4O60885 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD4O60885 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BRD4O60885 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD4O60885 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD4O60885 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD4O60885 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD4O60885 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD4O60885 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD4O60885 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD4O60885 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD4O60885 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD4O60885 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD4O60885 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD4O60885 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD4O60885 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD4O60885 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD4O60885 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD4O60885 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD4O60885 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD4O60885 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD4O60885 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD4O60885 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD4O60885 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD4O60885 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms