Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINK4O60575 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms