Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARCH6O60337 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms