Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX16O60231 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX16O60231 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX16O60231 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHX16O60231 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHX16O60231 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHX16O60231 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHX16O60231 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX16O60231 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX16O60231 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX16O60231 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX16O60231 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX16O60231 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX16O60231 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX16O60231 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX16O60231 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX16O60231 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX16O60231 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX16O60231 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms