Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP9BO43861 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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