Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP26A1O43174 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP26A1O43174 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP26A1O43174 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP26A1O43174 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP26A1O43174 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP26A1O43174 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYP26A1O43174 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYP26A1O43174 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP26A1O43174 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP26A1O43174 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP26A1O43174 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP26A1O43174 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP26A1O43174 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYP26A1O43174 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP26A1O43174 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP26A1O43174 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP26A1O43174 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP26A1O43174 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP26A1O43174 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP26A1O43174 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms