Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLXNB1O43157 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLXNB1O43157 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms