Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VGFO15240 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VGFO15240 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VGFO15240 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VGFO15240 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
VGFO15240 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VGFO15240 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VGFO15240 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VGFO15240 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VGFO15240 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VGFO15240 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VGFO15240 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VGFO15240 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VGFO15240 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VGFO15240 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VGFO15240 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VGFO15240 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VGFO15240 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VGFO15240 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGFO15240 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGFO15240 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGFO15240 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGFO15240 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGFO15240 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGFO15240 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VGFO15240 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGFO15240 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGFO15240 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VGFO15240 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGFO15240 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGFO15240 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGFO15240 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGFO15240 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGFO15240 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGFO15240 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGFO15240 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGFO15240 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGFO15240 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGFO15240 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGFO15240 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGFO15240 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGFO15240 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
VGFO15240 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
VGFO15240 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGFO15240 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGFO15240 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGFO15240 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGFO15240 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGFO15240 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGFO15240 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VGFO15240 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VGFO15240 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VGFO15240 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VGFO15240 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VGFO15240 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VGFO15240 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VGFO15240 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VGFO15240 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VGFO15240 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VGFO15240 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
VGFO15240 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VGFO15240 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VGFO15240 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VGFO15240 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VGFO15240 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VGFO15240 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VGFO15240 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VGFO15240 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VGFO15240 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VGFO15240 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VGFO15240 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VGFO15240 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VGFO15240 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VGFO15240 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VGFO15240 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VGFO15240 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VGFO15240 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGFO15240 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGFO15240 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGFO15240 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGFO15240 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGFO15240 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGFO15240 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGFO15240 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGFO15240 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGFO15240 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
VGFO15240 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGFO15240 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGFO15240 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGFO15240 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VGFO15240 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VGFO15240 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VGFO15240 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VGFO15240 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VGFO15240 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VGFO15240 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VGFO15240 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VGFO15240 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
VGFO15240 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VGFO15240 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
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