Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CUX2O14529 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CUX2O14529 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CUX2O14529 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CUX2O14529 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CUX2O14529 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CUX2O14529 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CUX2O14529 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CUX2O14529 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CUX2O14529 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CUX2O14529 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
CUX2O14529 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CUX2O14529 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CUX2O14529 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CUX2O14529 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CUX2O14529 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CUX2O14529 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CUX2O14529 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CUX2O14529 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CUX2O14529 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CUX2O14529 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CUX2O14529 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CUX2O14529 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CUX2O14529 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CUX2O14529 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CUX2O14529 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CUX2O14529 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CUX2O14529 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CUX2O14529 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CUX2O14529 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CUX2O14529 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CUX2O14529 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CUX2O14529 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CUX2O14529 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CUX2O14529 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CUX2O14529 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CUX2O14529 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CUX2O14529 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CUX2O14529 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CUX2O14529 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CUX2O14529 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CUX2O14529 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CUX2O14529 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CUX2O14529 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CUX2O14529 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CUX2O14529 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CUX2O14529 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CUX2O14529 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CUX2O14529 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CUX2O14529 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CUX2O14529 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CUX2O14529 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CUX2O14529 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CUX2O14529 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CUX2O14529 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CUX2O14529 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CUX2O14529 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CUX2O14529 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CUX2O14529 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CUX2O14529 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CUX2O14529 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CUX2O14529 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CUX2O14529 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CUX2O14529 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CUX2O14529 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CUX2O14529 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CUX2O14529 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CUX2O14529 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CUX2O14529 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CUX2O14529 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CUX2O14529 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CUX2O14529 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CUX2O14529 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CUX2O14529 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CUX2O14529 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CUX2O14529 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CUX2O14529 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CUX2O14529 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CUX2O14529 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CUX2O14529 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CUX2O14529 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CUX2O14529 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CUX2O14529 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CUX2O14529 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CUX2O14529 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CUX2O14529 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CUX2O14529 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CUX2O14529 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CUX2O14529 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CUX2O14529 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CUX2O14529 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CUX2O14529 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CUX2O14529 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CUX2O14529 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CUX2O14529 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CUX2O14529 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CUX2O14529 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CUX2O14529 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CUX2O14529 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CUX2O14529 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms